血液透析では、除水することにより、足がつったり、血圧が下がったりすることがよくあります。また透析前の尿素窒素があまり高いと、透析中に意識を無くしてけいれんを起こしたり、頭痛がしたり、吐いたりすることがあります。
特に透析導入時には、体内の血液に比べ、脳の中の老廃物が除去されにくいため、水分が脳の中に流れ込んでしまいます。その結果、脳がむくみ、脳の内圧が上がってしまうため不均衡症候群と呼ばれる頭痛・むかつき・嘔吐などがみられることがあります。
これらは、本来なら腎臓が1日24時間かけてやることを、限られた時間（通常1回4時間ぐらい）で血液透析で強制的に行うため、体が耐えられずに引き起こされる症状です。